Table 1 Forty statistically significant protein peaks are differentially expressed in normal and aneuploid AF samples

m/z ^(a)

Surface array

p -value ^(b)

AUC ^(c)

Normal

Aneuploidies

Fold Change

6080

CM10

0.00001

0.918

1.66

9.50

5.7

2876

CM10

0.0006

0.861

6.37

20.96

3.3

15944

IMAC

0.0013

0.838

4.12

1.99

0.5

3023

CM10

0.0015

0.837

10.06

27.88

2.8

7970

IMAC

0.0016

0.833

4.78

2.67

0.6

6194

CM10

0.003

0.817

1.55

9.75

6.3

3903

IMAC

0.0037

0.810

7.85

2.90

0.4

8455

CM10

0.0065

0.793

38.28

26.92

0.7

22214

CM10

0.0065

0.793

0.30

0.16

0.5

9626

IMAC

0.0068

0.790

5.19

3.01

0.6

24720

Q10

0.0079

0.781

0.58

0.48

0.8

9467

IMAC

0.0105

0.776

6.05

4.02

0.7

3173

Q10

0.0118

0.768

4.64

2.04

0.4

18977

IMAC

0.012

0.771

0.61

0.29

0.5

4323

Q10

0.0134

0.763

5.66

9.47

1.7

5655

Q10

0.0134

0.763

5.47

2.92

0.5

14017

IMAC

0.0137

0.767

4.82

2.65

0.5

3184

CM10

0.0151

0.764

2.93

8.41

2.9

3435

IMAC

0.0157

0.762

2.66

9.04

3.4

8660

CM10

0.0172

0.760

4.95

3.00

0.6

9276

IMAC

0.0178

0.757

1.90

4.11

2.2

12289

IMAC

0.0178

0.757

4.97

3.33

0.7

15056

Q10

0.0194

0.750

0.78

1.31

1.7

3383

CM10

0.0196

0.755

7.24

12.71

1.8

13761

IMAC

0.0202

0.752

6.15

4.10

0.7

7655

Q10

0.0245

0.741

4.52

6.56

1.5

14014

Q10

0.0245

0.741

4.56

2.72

0.6

11670

CM10

0.0251

0.744

3.19

1.92

0.6

4954

IMAC

0.0259

0.743

14.73

10.19

0.7

7007

Q10

0.0275

0.737

3.85

1.98

0.5

6892

Q10

0.0308

0.732

4.34

3.26

0.8

8203

Q10

0.0308

0.732

5.80

3.45

0.6

9159

Q10

0.0308

0.732

9.03

7.82

0.9

11314

Q10

0.0344

0.728

6.90

4.10

0.6

8574

IMAC

0.0367

0.729

12.48

7.55

0.6

4519

Q10

0.0472

0.714

1.44

2.27

1.6

4901

Q10

0.0472

0.714

3.61

2.25

0.6

13809

Q10

0.0472

0.714

4.20

2.73

0.6

49297

Q10

0.0472

0.714

0.21

0.16

0.8

11303

CM10

0.0499

0.716

2.62

1.90

0.7